2011年，公司完成股份制改造，整體變更為北京中科科儀股份有限公司，完善公司治理結構、聚焦主營業務，進入高科技企業的歷史發展階段。

2000年，在國家“推動應用性型科研機構企業化轉制”背景下，成為中科院第一家事業單位整體轉改制企業，更名為“北京中科科儀技術發展有限責任公司”，進入現代化企業改造期。逐步發展成為集科學儀器研發、制造、銷售和服務為一體的高新技術企業。

1991年，正式更名為中國科學院北京科學儀器研制中心，成為自收自支的事業單位。期間，加速市場化進程，產品進入科研、航天、軍工、核工業領域。

1958年，中國科學院科學儀器廠成立。建廠初期業務定位為全院機械加工制造中心，為我國“兩彈一星”加工制造做出重要貢獻。1970年，科儀廠重建，主營業務由機電加工向科學儀器研制轉變。1985年，全面實施經營體制改革，中科院不再核撥行政事業費，探索企業化發展道路。